Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC9A8Q9Y2E8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC9A8Q9Y2E8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC9A8Q9Y2E8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC9A8Q9Y2E8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC9A8Q9Y2E8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A8Q9Y2E8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms