Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD1BQ9UPS6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD1BQ9UPS6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms