Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms