Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms