Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms