Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms