Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REV1Q9UBZ9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms