Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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