Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms