Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHST12Q9NRB3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHST12Q9NRB3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms