Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE7BQ9NP56 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms