Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTRT3Q9BYD9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms