Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5DQ9BY66 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms