Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TP53INP1Q96A56 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms