Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCTD13Q8WZ19 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms