Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms