Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AVL9Q8NBF6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms