Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUDCD3Q8IVD9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms