Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD163Q86VB7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD163Q86VB7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms