Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms