Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms