Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms