Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL17Q6TDP4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms