Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SDE2Q6IQ49 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms