Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms