Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF628Q5EBL2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms