Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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