Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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