Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms