Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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ECM1Q16610 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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