Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SGCAQ16586 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCAQ16586 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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