Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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GRIK5Q16478 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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GRIK5Q16478 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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GRIK5Q16478 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK5Q16478 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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