Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CCDC6Q16204 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CCDC6Q16204 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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