Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
USF2Q15853 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
USF2Q15853 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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