Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms