Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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