Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM25Q14258 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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