Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms