Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOFQ13790 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOFQ13790 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms