Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2Q13563 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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