Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms