Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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