Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP4Q13115 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms