Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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