Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BNIP1Q12981 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms