Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TROQ12816 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TROQ12816 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TROQ12816 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TROQ12816 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TROQ12816 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TROQ12816 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TROQ12816 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TROQ12816 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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