Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWF1Q12792 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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