Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXO1Q12778 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FOXO1Q12778 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXO1Q12778 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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