Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF5Q12774 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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