Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM1Q08AH1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms